El SII, dispone de una aplicación gratuita para emitir documentos electrónicos, si su empresa es muy pequeña y no puede pagar el costo de automatizar la emisión de estos documentos le recomendamos que visite el link del servicio y conozco como emitir documentos sin pagar.
En realidad el servicio si tiene un costo, ya que deberá comprar un certificado digital que tiene un costo entre los $ 15.000 y $ 30.000 dependiendo de la empresa que elija.
Con ese certificado se podrá inscribir en el sitio del servicio y podrá emitir documentos electrónicos sin pagar.
http://www.sii.cl/factura_electronica/factura_sii/factura_sii.htm
Cómo emitir facturas electrónicas si soy una PYME